MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	11496844
2	NC_001856	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
3	NC_001856	A	7	7	4649	4655	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
4	NC_001856	GTA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
5	NC_001856	TAA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
6	NC_001856	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
7	NC_001856	A	7	7	4733	4739	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
8	NC_001856	ACT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
9	NC_001856	TCC	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496844
10	NC_001856	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
11	NC_001856	ACCA	2	8	4899	4906	50 %	0 %	0 %	50 %	11496844
12	NC_001856	A	8	8	4925	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
13	NC_001856	A	7	7	4938	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
14	NC_001856	CTA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
15	NC_001856	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
16	NC_001856	TTA	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496844
17	NC_001856	GTAT	2	8	5048	5055	25 %	50 %	25 %	0 %	11496844
18	NC_001856	TAA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
19	NC_001856	AAT	2	6	5086	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
20	NC_001856	ATG	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
21	NC_001856	A	7	7	5122	5128	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
22	NC_001856	CAT	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
23	NC_001856	TAA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
24	NC_001856	A	6	6	5139	5144	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
25	NC_001856	ATAAA	2	10	5162	5171	80 %	20 %	0 %	0 %	11496844
26	NC_001856	AAT	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
27	NC_001856	TGA	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
28	NC_001856	CTTT	2	8	5270	5277	0 %	75 %	0 %	25 %	11496844
29	NC_001856	T	6	6	5275	5280	0 %	100 %	0 %	0 %	11496844
30	NC_001856	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496844
31	NC_001856	TAAA	2	8	5369	5376	75 %	25 %	0 %	0 %	11496844
32	NC_001856	AGA	2	6	5379	5384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
33	NC_001856	CTT	3	9	5405	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496844
34	NC_001856	GAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
35	NC_001856	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
36	NC_001856	TAA	2	6	6099	6104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496832
37	NC_001856	TAC	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496832
38	NC_001856	TTTATT	2	12	6121	6132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496832
39	NC_001856	ATC	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496832
40	NC_001856	AAT	2	6	6188	6193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496832
41	NC_001856	CAAATT	2	12	6222	6233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496832
42	NC_001856	A	7	7	6241	6247	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
43	NC_001856	TTA	2	6	6275	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496832
44	NC_001856	AAG	2	6	6303	6308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
45	NC_001856	ACA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
46	NC_001856	TTAAT	2	10	6381	6390	40 %	60 %	0 %	0 %	11496832
47	NC_001856	CTG	2	6	6396	6401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496832
48	NC_001856	CAA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
49	NC_001856	A	6	6	6424	6429	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
50	NC_001856	A	6	6	6468	6473	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
51	NC_001856	AAG	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
52	NC_001856	AGC	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496832
53	NC_001856	CAA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
54	NC_001856	A	6	6	6582	6587	100 %	0 %	0 %	0 %	11496832
55	NC_001856	ATCAGA	3	18	6589	6606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11496832
56	NC_001856	ATTCTG	2	12	6615	6626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496832
57	NC_001856	ATAAA	2	10	6732	6741	80 %	20 %	0 %	0 %	11496832
58	NC_001856	AGC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496832
59	NC_001856	AAG	2	6	6834	6839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
60	NC_001856	TAAA	3	12	6860	6871	75 %	25 %	0 %	0 %	11496832
61	NC_001856	TA	4	8	7781	7788	50 %	50 %	0 %	0 %	11496846
62	NC_001856	AAT	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496846
63	NC_001856	CGC	2	6	7901	7906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11496846
64	NC_001856	T	6	6	7928	7933	0 %	100 %	0 %	0 %	11496846
65	NC_001856	TA	3	6	8883	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	11496848
66	NC_001856	TAT	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496848
67	NC_001856	T	6	6	9050	9055	0 %	100 %	0 %	0 %	11496848
68	NC_001856	CAA	2	6	9062	9067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496848
69	NC_001856	CAA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496848
70	NC_001856	T	6	6	10514	10519	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
71	NC_001856	T	6	6	10521	10526	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
72	NC_001856	T	7	7	10528	10534	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
73	NC_001856	TC	3	6	10564	10569	0 %	50 %	0 %	50 %	11496834
74	NC_001856	T	6	6	10583	10588	0 %	100 %	0 %	0 %	11496834
75	NC_001856	AAT	2	6	10590	10595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496834
76	NC_001856	TA	3	6	10631	10636	50 %	50 %	0 %	0 %	11496834
77	NC_001856	CTT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496834
78	NC_001856	TA	3	6	10892	10897	50 %	50 %	0 %	0 %	11496834
79	NC_001856	ATA	2	6	10919	10924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496834
80	NC_001856	TAT	2	6	10943	10948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496834
81	NC_001856	ATC	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496834
82	NC_001856	ATT	2	6	10989	10994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496834
83	NC_001856	TTC	2	6	11037	11042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496834
84	NC_001856	CTT	2	6	11075	11080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496834
85	NC_001856	T	6	6	11168	11173	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
86	NC_001856	CTT	2	6	11187	11192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496835
87	NC_001856	TAT	2	6	11250	11255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496835
88	NC_001856	AAT	2	6	11256	11261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
89	NC_001856	TA	3	6	11275	11280	50 %	50 %	0 %	0 %	11496835
90	NC_001856	TA	3	6	11295	11300	50 %	50 %	0 %	0 %	11496835
91	NC_001856	TAA	2	6	11337	11342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
92	NC_001856	ACA	2	6	11351	11356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496835
93	NC_001856	T	7	7	11385	11391	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
94	NC_001856	AAT	3	9	11440	11448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
95	NC_001856	GTA	2	6	11456	11461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496835
96	NC_001856	T	6	6	11471	11476	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
97	NC_001856	TAAAAC	2	12	11481	11492	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496835
98	NC_001856	TTA	2	6	11573	11578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496835
99	NC_001856	TCA	2	6	11600	11605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496835
100	NC_001856	TAA	2	6	11683	11688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496835
101	NC_001856	T	6	6	11779	11784	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
102	NC_001856	T	7	7	11875	11881	0 %	100 %	0 %	0 %	11496835
103	NC_001856	TA	3	6	11891	11896	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
104	NC_001856	T	6	6	11908	11913	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
105	NC_001856	TA	3	6	11933	11938	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
106	NC_001856	CTTT	2	8	11992	11999	0 %	75 %	0 %	25 %	11496836
107	NC_001856	T	7	7	12003	12009	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
108	NC_001856	TAAATT	2	12	12059	12070	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
109	NC_001856	ATA	2	6	12075	12080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496836
110	NC_001856	T	7	7	12084	12090	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
111	NC_001856	TAT	2	6	12104	12109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
112	NC_001856	A	9	9	12118	12126	100 %	0 %	0 %	0 %	11496836
113	NC_001856	CCAT	2	8	12144	12151	25 %	25 %	0 %	50 %	11496836
114	NC_001856	TTG	2	6	12169	12174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496836
115	NC_001856	TCT	2	6	12175	12180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496836
116	NC_001856	TAAA	2	8	12197	12204	75 %	25 %	0 %	0 %	11496836
117	NC_001856	TAA	2	6	12205	12210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496836
118	NC_001856	T	8	8	12211	12218	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
119	NC_001856	ATT	2	6	12219	12224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
120	NC_001856	AT	3	6	12306	12311	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
121	NC_001856	T	7	7	12311	12317	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
122	NC_001856	TTC	2	6	12327	12332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496836
123	NC_001856	A	6	6	12339	12344	100 %	0 %	0 %	0 %	11496836
124	NC_001856	TTCT	2	8	12350	12357	0 %	75 %	0 %	25 %	11496836
125	NC_001856	TTTA	2	8	12366	12373	25 %	75 %	0 %	0 %	11496836
126	NC_001856	TAT	2	6	12374	12379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
127	NC_001856	CTT	2	6	12392	12397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496836
128	NC_001856	TTA	2	6	12404	12409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496836
129	NC_001856	T	7	7	12414	12420	0 %	100 %	0 %	0 %	11496836
130	NC_001856	TGT	2	6	12486	12491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496837
131	NC_001856	T	7	7	12525	12531	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
132	NC_001856	ATTTT	2	10	12626	12635	20 %	80 %	0 %	0 %	11496837
133	NC_001856	TCT	2	6	12674	12679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496837
134	NC_001856	T	6	6	12679	12684	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
135	NC_001856	T	8	8	12762	12769	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
136	NC_001856	TTC	2	6	12796	12801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496837
137	NC_001856	T	6	6	12816	12821	0 %	100 %	0 %	0 %	11496837
138	NC_001856	ATT	2	6	12826	12831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496837
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